XV sajandist pärit Karula Maarja kirik hävis II maailmasõjas.

EELK Karula Maarja kogudus tegutseb vanast mõisaaidast ümber ehitatud hoones, mis pühitseti pühakojaks 1997.aastal.
Uuele kirikule valmistas altari, altarivõre ja laulunumbrialuse Kalmer Daniel – puutöömeister Rebasemõisast. Tema restaureeris ka Tallinna Jaani Seegi kirikust eemaldatud ja peaaegu hävinenud kantsli. Kiriku rõdud kandvad osad on koguduse juhatuse esimehe Jaan Kõvaski kätetöö. Rõdu kandetala ja toepostid raius ta välja palgist üksnes kirvest kasutades. Kiriku toolid, krutsifiksi ja altarikatted kinkis kirikule sõpruskogudus Hämeenkoskist, kes toetas ka kiriku ehitust. 2001 aastal valmis altarivitraaz, mille valmistas Dolores Hoffmann ning millel on kujutatud Püha Õhtusöömaaega. Vitraaz pühitseti 24. juunil 2001. aastal ja pühitsemistalitusel osalesid Dr.Karl-Heinrich von Grote oma perekonna ja sugulastega, kes olid kauni kunstiteose kinkijateks kirikule.